一般に.胆石による慢性的な感染が胆嚢上皮を刺激して増殖し.長期的にはがん化すると考えられています。胆石の大きさは.胆嚢がんの発生確率と正の相関があることが報告されています。また.胆嚢壁の石灰化を伴う慢性胆嚢炎では.12.5～61％の確率で癌化することが報告されています。 6匹の猫の胆嚢に少量のメチルコラントレンを移植したところ.5匹の猫に胆嚢がんが発生した。胆汁中のコレステロールや胆汁酸塩は.クロストリジウム・パーフリンゲンスなどの嫌気性菌によってメチルコラントレンに似た化学構造に変化するため.胆汁に含まれるこれらの発がん性因子が胆嚢がん発生に関係していると考えられている。 また.総胆管下部と主膵管の合流部の奇形が胆嚢がんの発生に関係するという説もある。また.食事要因.細菌や寄生虫の感染.胆石など様々な要因で胆嚢がんが発生すると考えられています。 胆管がんも胆石と密接な関係があり.胆管がんの64～100％が胆石と合併していると報告されていますが.胆管がんは胆嚢がんほど胆石と密接な関係がないとの見方もあります。胆管がんの発生には.慢性潰瘍性大腸炎やSchistosoma haematobium感染が関係することが報告されています。胆管がんは先天性総胆管嚢胞患者の約18％に発生し.通常.嚢胞の後壁または嚢胞周囲の胆管に発生することがある。原発性硬化性胆管炎と胆管癌の関係については.いまだに議論の余地があります。原発性硬化性胆管炎そのものは.悪性度が低く進行が遅い胆管がんの一種であるという考え方もあります。