子宮内膜症の治療は薬物療法と手術療法に分けられ.手術療法が必要な患者は以下の通りである：1.症状や徴候が子宮内膜症の病巣を示唆し.同時に臨床症状が月経困難症の進行性悪化や性交時深部痛などの二次的なもので.膣後鼻孔に触知可能な結節がある場合；2.超音波検査や磁気共鳴画像検査で子宮異所性病巣の明確な焦点があり.範囲が大きいことが判明した場合。 3.膣超音波検査で.卵巣チョコレート嚢胞の直径が4センチ以上と大きすぎることが示唆された場合.4.チョコレート嚢胞の悪性化の可能性.または多発性嚢胞の可能性を排除することができない場合.5.不妊症の患者との組み合わせ.または薬物治療が満足のいくものではなく.患者の症状がより明白である場合.6.卵管閉塞や腸狭窄がある場合.患者に起因する異所性病巣の検討。