お灸後の腰痛の原因としては、やけど、リウマチ熱性麻痺型腰痛、腰椎椎間板ヘルニアの急性期などが一般的である。
1.やけど：お灸をしている時に、もぐさ棒が局部に長くとどまったり、もぐさ棒の交換が間に合わなかったりして、腰の皮膚にやけどをすると、お灸をした後に腰痛を感じます。
2.リューマチ熱麻痺型腰痛：リューマチ熱麻痺による腰痛の場合、お灸をしても痛みが取れないだけでなく、お灸の温かさによって痛みが悪化することもあります。
3.腰椎椎間板ヘルニアの急性期：腰椎椎間板ヘルニアの急性期にお灸をしても、病気の進行が早いため、一般的に痛みをすぐに止めることができず、お灸をしても腰痛の症状が残ってしまいます。
お灸をした後、腰痛がある場合、普通の病院に行って、病気の原因を調べて、積極的に専門の医者の治療に協力しなければなりません。