洞結節機能障害の主な治療法はペースメーカーの装着であり、急性期治療にはアトロピンなどの薬剤を用いるが、無症状の患者には必要ない。 無症状の洞結節機能不全患者は治療の必要はなく、β遮断薬（メトプロロールなど）のような洞性徐脈性不整脈を引き起こす可能性のある薬剤を使用している場合は、可能であればその薬剤を中止する。 アトロピンおよび/またはイソプレナリンによる急性期治療が可能であり、静脈内一時ペースメーカーが必要な場合もある。 徐脈性不整脈のある患者-頻脈性不整脈は、心配糖体、キニジン、ジゴキシンでコントロールできるが、外来心電図モニタリングが必要であり、不整脈や症状が悪化した場合は永久ペースメーカーの装着が必要である。 ペースメーカー治療は、慢性症候性洞結節機能不全患者に対する唯一の有効な外科的治療であり、永久ペースメーカー、単室型ペースメーカー、両室型ペースメーカーがある。 患者さんは体調が悪いときには医師の診察を受け、医師の指示に従って対症療法を行うことが推奨される。