ハトムギはやや温性で、味は甘く、補気昇陽、止表止汗、利尿消腫、疏泄滞麻痺、疏毒排膿（膿や毒を体外に排出すること）、収斂活絡（ただれを早く治し、新しい肉の成長を促進すること）の作用がある。 ハトムギは、自然発汗（昼間に不随意に汗をかき、ちょっとした動作で悪化する）、気虚による内臓脱、長引く下痢や肛門脱、食欲不振、血便などの気虚（体の気が弱く、整理が不十分になる）の治療に用いることができます。また、気血両虚による顔の黄ばみ、なかなか破れない癰、長い間収縮しない潰瘍の治療にも用いることができ、気虚や血の滞りによって自由に動かせない手足の治療にも用いることができます。
女性だけでなく男性にもハトムギの副作用は明らかではないが、表邪（筋肉の表面の邪）発作、気滞湿閉、食滞などの実症状があるものには用いないこと、ハトムギは陽気を促進する効能があるので、陰虚亢進、陽気亢進などの虚実混合症状（虚実の症状が体内にある）には用いないこと、また、病初期の癰壊疽や潰瘍後の発熱などの固形爛瘍には用いないことに注意する。
ハトムギの悪い作用や副作用は明らかではないので、ハトムギを使用したい場合は、使用前に医師に相談することをお勧めします。