術後乳管乳頭腫の良性判定が不確定な病理所見に対して免疫組織化学を行うことは可能であり、一般的には免疫組織化学を行うことが推奨され、患者は自分の状況に応じて免疫組織化学を行うかどうかを選択することができる。 手術後の乳管乳頭腫の病理検査で良性かどうかはっきりしない場合、主に細胞の出所を特定するために免疫組織化学検査を行うことを義務付けている病院もあり、後期の判断に役立ちます。 病理検査で乳管内乳頭腫であることが明らかであれば良性であるが、通常は発生源をはっきりさせるために免疫組織化学検査を追加することが推奨される。 免疫組織化学は通常、病変の形態から鑑別診断が困難な病態の場合、医師が鑑別診断するために必要となる。 患者の病理学的診断で良性の確信が持てない場合は、さらに免疫組織化学検査を行い、分子診断から腫瘍の性質を決定することを薦める。 条件が許せば、病理診断の精度を高めるために、患者に免疫組織化学検査を受けることを薦める。