慢性萎縮性胃炎は癌化する可能性があるが、その可能性は低く、通常5％以下である。 慢性萎縮性胃炎の発癌率は、患者の重症度や罹病期間と関係しており、通常、軽度の慢性萎縮性胃炎では発癌することはなく、重度の慢性萎縮性胃炎でも胃癌になるにはかなりの時間がかかります。 慢性萎縮性胃炎から胃癌になるには、胃癌が現れる前に腸管形質転換と異型過形成の過程を経る必要がある。 検査で腸管形質転換、上皮内新形成、異型過形成を伴う慢性萎縮性胃炎が見つかった場合、がんの可能性は通常5％前後です。 したがって、慢性萎縮性胃炎でがんが発生する可能性は比較的低い。 患者は定期的な検査を受け、医師の指導の下で積極的な治療を受ける必要がある。