便DNAは腸癌の一定の検出率はあるが、一定の偽陽性率があり、臨床的に腸癌の診断を確定するものではない。 糞便DNA検査の陽性結果は腸癌の可能性を考慮したものに過ぎず、診断の確定にはさらに大腸内視鏡検査が必要である。
糞便DNA検査による腸癌の検出は非侵襲的な検査であり、基本的に患者には無害であるが、この検査を臨床に応用するには、さらに大規模な臨床研究データによる裏付けが必要である。
腸癌の臨床診断にとって最も重要なことは侵襲的大腸内視鏡検査であり、顕微鏡下で疑わしい組織の生検標本を病理学的に検査し、顕微鏡下で何が見えるかを調べることによって腸癌の臨床診断を行うのが最も正確な方法である。