五苓散は主に水湿や痰飲（水液の代謝障害の結果形成される病的産物）の内部停滞の治療に用いられ、現代のクリニックでは様々な病因による水腫や胃腸障害の治療に用いることができ、一般的に膝窩嚢腫の治療には用いられない。 五苓散は利水・滲湿（水の運行を促進して湿を除く）、温陽化気（体内の陽気を温める）の効能があり、好ましくない排尿（スムーズでない排尿）、微熱を伴う頭痛、過敏な飲渇、あるいは水を飲むと嘔吐するなどの症状を伴う水滞症候群（スムーズでない排尿、腹部の膨満感、水の渇き、飲み終わると嘔吐するなどの症状が現れる症候群の一種）の治療に用いることができる。 痰飲（臍下丹田、唾液を吐く、めまい、息切れ、咳などの症状）、水湿内滞（水湿が体内にとどまる）、水腫、下痢、排尿困難、コレラの嘔吐・下痢などの症状にも用いる。 この処方の副作用や禁忌はわかっていない。 不快な症状が現れたら、すぐに医師に相談し、医師の診断のもとで薬を選ぶべきである。