結膜嚢胞には、先天性、着床性、炎症性滲出性結膜嚢胞がある。
1.先天性結膜嚢胞：臨床ではまれで、結膜母斑に透明な小さな嚢胞を含むことが多い。
2.嵌頓性結膜嚢胞：臨床で最も多く、多くは結膜破裂や術後にみられ、一般に上皮細胞が結膜下に嵌頓するため、上皮細胞は生存可能となり、増殖して塊となり、中心部で変性と液化が起こり、嚢胞性空洞を形成する。
3.炎症性滲出性結膜嚢胞：主に慢性炎症による結膜への長期的な刺激が原因で、上皮細胞が増殖し、内向きに成長し、細胞集団が形成され、中心部が変性・液状化して嚢胞性空洞を形成する。
結膜嚢胞の患者は直ちに医師に相談し、病気の原因を特定し、治療を受けなければならない。通常、目の外傷を避け、汚れた手で目をこすらず、目の衛生に注意し、目の炎症を防がなければならない。