よもぎ茶の効能は、解毒・清熱、月経・血液の調整、むくみ、利尿作用がある。
1.解毒清熱、癰腫毒、怪我、打撲傷に用いる。 アンゼリカ、セイヨウタンポポ、ヒノキ、苦参などと併用することが多い。
2.月経を調整し、血液循環を活発にする。月経困難症、無月経、月経不順、産後の月経困難症に用いる。 Angelica sinensis、Boswellia serrata、Rhizoma Ligustici Chuanxiongと組み合わせて使用されることが多い。
3.水腫と利尿を抑える。主に水腫と排尿障害に用いられるが、瘀血を解消して血液循環を活性化する作用もあるので、瘀水や瘀血による水腫にもよく用いられる。 単独で使用することも、ゼランや白毛玄など他の薬と併用することもできる。 また、瘀血や血熱の停滞による血色証（痛みを伴う血尿の出現）や血尿にも用いることができ、麦門冬やオオバコなど他の薬と併用することが多い。
ただし、漢方薬の使用には専門の医師の指導が必要であり、必要に応じて医師の指導のもとで合理的に使用することが勧められる。