臨床における無精子症の原因はいろいろありますが、一般的なものは精嚢、前立腺、尿道の炎症、射精管や精嚢の嚢胞や閉塞、前立腺や精嚢の腫瘍などです。 原因によって治療法は異なり、主に一般治療（禁欲など）、薬物治療（アモキシシリンなど）、外科治療に分けられる。
1.炎症：多いのは精嚢や前立腺などの炎症で、患部の粘膜のうっ血や水腫を起こし、血精液症を引き起こします。 治療としては、重症度に応じて射精回数を減らすか、あるいは禁欲する必要があり、細菌感染が原因の場合は、アモキシシリンなどの抗菌薬の抗感染治療を行います。
2.嚢胞や閉塞：射精管、精嚢、前立腺などに嚢胞や閉塞がある場合、炎症による閉塞の場合はレボフロキサシンなどの抗感染治療を行いますが、保存的治療が無効な場合は、嚢胞摘出やドレナージなどの外科的治療が必要になることが多いです。
3.腫瘍：精嚢や前立腺などの良性・悪性腫瘍は、周囲組織への圧迫や浸潤により血便を起こすことがあります。 良性腫瘍は手術のみで摘出可能ですが、悪性腫瘍の場合は手術で摘出した後、放射線療法、化学療法、その他の補助療法が必要になることがあります。
血精液症の患者さんは、適時に医師に相談し、すべての検査を終えて、病気の原因をはっきりさせ、病気の原因に応じて専門の医師の治療を受け、薬も専門の医師の指導のもとで使用することをお勧めします。