2穴心房中隔欠損症の重症度は.欠損の大きさと他の複合心奇形の有無によって決定される。患者が無症状で.欠損が5mm以下であれば.この状態は深刻ではなく.多くの患者は心房中隔欠損を発症することなく生涯持ち続けることができる。この状態は.定期的に心臓超音波検査を行い.肺高血圧症や右心不全などがないことを確認しながら.観察していくことができます。心房中隔欠損が36mm以上と非常に大きい場合は.より大きな中隔欠損であり.外科的な開心術で中隔欠損を塞ぐ必要があり.より重症なタイプになります。2穴心房中隔欠損症の患者を定期的に治療しないと.後期に重篤な不整脈.右房右室肥大.重症肺高血圧.右心不全などが発生し.これもより重篤なタイプなので.適時封鎖治療が必要です。末期に右左シャントが発生した場合は.最も重症で.手術の機会も失われ.5年生存率も低くなります。