グルタルアルデヒドは一般に、B型肝炎ウイルスを破壊するのに15～20分の浸漬を必要とする。 グルタルアルデヒドは微生物を死滅させる広範な能力を有し、細菌増殖体、細菌芽胞、ウイルス、その他の病原微生物を死滅させることができる。 グルタルアルデヒドの初期濃度は原則として2％以上であるが、アルカリ性グルタルアルデヒドの重合、水による希釈、使用頻度など、使用中にグルタルアルデヒドの濃度が低下する要因は多いので、グルタルアルデヒドの濃度を毎日モニターする必要がある。 グルタルアルデヒドは2つのアルデヒド基を持つため、2つのアミノ基と水酸基（主にアミノ基）と反応し、タンパク質内の架橋を促進することができ、この架橋の増加はタンパク質の二次構造を破壊するため、タンパク質の変性につながり、消毒の目的を達成することができる。 グルタルアルデヒドは皮膚や粘膜を刺激し、非専門家は接触しないようにする必要があり、溶液に接触する必要がある場合は、目や吸入に飛散を防ぐために手袋を着用する必要があります。