肥大型心筋症が発症すると.β遮断薬のメトプロロール.カルシウム遮断薬のベラパミルなどの流出路閉塞改善薬や.プロベネシドなどの候補薬の早期適用が必要である。肥大型心筋症は心不全の問題を誘発するため.アンジオテンシン変換酵素阻害薬のエナラプリル.アルドステロン受容体拮抗薬のスピロノラクトンなど心筋のリモデリングを抑制する薬剤の定期適用が必要である。心房細動もある場合は.心房細動のエピソードを減らすためにアミオダロンの定期的な塗布が必要であり.永久心房細動では心拍数をコントロールするためにメトプロロールが検討できる。重度の流出路閉塞が生じ.薬物療法の効果が得られない場合は.早期の外科的治療が推奨される。