難治性てんかんでは.発生病巣の局在を確認した上で.外科的治療が検討されることがあります。従来の手術は開頭して「てんかん原性焦点」を除去したり.伝導路を切断したりするもので.侵襲的な治療であり一定のリスクを伴うが.ガンマナイフは病巣を正確に計算し.集中して照射するものである。現在の経験では.一般に少ない照射量で.脳組織を破壊せず.脳組織の正常な機能に重大な障害を与えず.異常な過剰放電のみを抑制し.てんかんの治療という目的を達成することができます。しかし.頭蓋骨を開けないため.発作の発生源の局在が特に重要であり.経験上.ガンマナイフで治療できる患者さんはごく一部に限られます。