B型肝炎小三陽における肝臓内の石灰化病巣は、B型肝炎ウイルス感染によるものかもしれないし、外傷、他の微生物感染、あるいは先天性によるものかもしれない。
B型小三元肝炎患者における肝内石灰化巣の発見は、慢性B型肝炎ウイルス感染時にウイルス感染によって引き起こされた肝臓内の炎症性損傷の結果として石灰化巣が形成され、その修復治癒が行われ、その過程でカルシウム沈着が起こるためと考えられる。
さらに、肝臓への偶発的な外傷、細菌や寄生虫などの微生物による感染、関連する傷害も同様に、回復過程で石灰化病巣の形成につながる可能性がある。
このような傷害的要因に加え、先天的に器官の発達に異常がある人もいるが、その正確なメカニズムは不明である。
肝臓の石灰化病巣は比較的一般的な疾患であるため、病巣を発見した場合は速やかに医師に相談し、必要に応じて肝機能検査を行い、原因治療を迅速に行うことが推奨される。