耐性菌は.抗生物質が適用された初期に確認され.当初は代謝の変化が起こり.細菌が薬剤に適応していると考えられていた。 細菌は薬剤に触れて初めて耐性を獲得し.薬剤が存在しなくなると耐性が消失する。 一度耐性を獲得すると.病巣内のすべての細菌が薬剤に耐性を持つようになる。 しかし.その後の研究により.細菌の耐性は自然変異によるものが多いことが分かってきた。 変異株そのものは.一般に薬剤非依存性である。 しかし.抗生物質は2つの方法で耐性に影響を与える。まず.一部の抗生物質は突然変異を促進する変異原として作用することである。 第二に.自然発生的な変異株は感受性株と共存しているため.菌叢全体が感受性であるにもかかわらず.この変異株を殺すために抗生物質を十分に投与しないと.感受性株が殺され.耐性株が増殖して優勢になり.菌叢全体が薬剤耐性となるのである。 抗生物質は感受性の高い細菌は殺すが.耐性菌は残す.細菌の耐性は「選択」される.これが抗生物質の「選択圧」である。