大動脈弁閉鎖不全症の予後は、病変の性質（急性、慢性）および病変の程度（軽度、中等度、重度）によって大きく異なる。 軽度の場合は数十年続くこともあるが、症状が明らかで積極的に治療しなければ、生存に重大な影響を及ぼし、突然死に至ることさえある。 慢性大動脈弁閉鎖不全症の場合、軽症例は外科的治療を行わなければ通常20年以上持続するが、いったん症状が現れると急速に悪化し、5年以内に狭心症で半数が死亡し、2年以内に重症左心不全で半数が死亡する。 急性大動脈弁閉鎖不全症は、軽症の場合は無症状で、進行が早く、突然の呼吸困難、横になれない、重症になると過敏症、錯乱、昏睡になり、外科的治療が適時に行われないと、急性左心不全で死亡することもあります。 大動脈弁閉鎖不全症の症状のほとんどは外科的治療によってかなり改善されるため、診断されたら積極的に治療し、病気の進行による不利益を避けることをお勧めします。