外科的治療：先天性水頭症のお子さんの50％は.2歳から5歳の間に自然寛解し.静水頭症と呼ばれ.治療の必要がありません。 残りの50％は.頭蓋骨が著しく拡大し.大脳皮質の厚さが1cm以上の進行性水頭症で.外科的治療が可能であり.手術は次のように分けられる： a. 原因別治療：占拠病巣の除去.Arnold-Chiari奇形に対する後頭蓋陥凹と上頭蓋板の減圧.閉鎖を解消するための閉鎖症に対する第四脳室正中孔切開.脈絡叢切除や 脳脊髄液の分泌を抑制する電気メスなど。 原因が改善されず.薬物療法が無効な場合は.病変や閉塞部位に応じて頭蓋内または頭蓋外の脳脊髄液シャントが使用されることがあります。 脳室-小脳プールドレナージや三脳瘻などの頭蓋内シャントが一般的に使用されます。 重度の水頭症.知能の低下.失明.麻痺.脳実質の明らかな萎縮.皮質の厚さが1cm以下の場合は.手術は勧められない。