百日咳は.百日咳菌という細菌によって引き起こされる急性呼吸器感染症で.強い感染力があります。百日咳の潜伏期間は7～14日で.最長で21日です。典型的な患者さんは6～8週間の全経過をたどり.3期に分けられます。
1. カタル性期。1~2週間.鼻水.咳.微熱などの上気道症状として現れる。
2.痙攣性咳嗽（けいれんせいがいそう）期。2～4週間.発作的な痙攣性咳嗽が主な症状です。一回の咳は十数回から数十回で.粘液質の痰を吐いたり.胃の内容物を吐き出したりします。この後.鶏のような深く長い吸気音が続きます。痙攣性咳嗽では.子供の目は開き.顔は赤く青く.肘を曲げて拳を握り.舌は外側に伸び.頸静脈は怒張し.胴体は塊状に曲がる。痙攣時に舌が伸びて下切歯と擦れると.舌靱帯が潰瘍化することがある。咳が長く続くと.胸腔内圧の上昇により頭頸部静脈が閉塞し.顔面眼瞼浮腫や結膜下出血を生じます。痙攣性咳嗽を繰り返すと.無気力.食欲不振.嘔吐が頻繁に起こり.栄養失調を起こしやすくなります。新生児や小児では典型的な痙攣性咳嗽は見られず.数回咳をした後.息を止めてチアノーゼ.窒息.さらには痙攣や心停止が見られることが多い。
3.回復期。1～2週間.発作的な咳の回数が減り.程度も軽くなり.徐々に治りますが.煙や冷気などの刺激や上気感で.再び百日咳のような発作的な咳が出ることがあります。