過去10年間で.慢性便秘の研究は大きく進歩した。 国際的には.慢性機能性便秘を含む機能性消化管疾患のRome III基準が導入されている。 定義：慢性機能性便秘は.腸管自体に起因する便秘と全身的な器質的原因.およびその他の要因を除外する必要があり.以下の基準を満たす：過去12ヵ月間に.少なくとも12週間の連続期間または累積期間において.以下の症状のうち2つ以上が認められる：(1)排便に手間取ることが1/4以上ある.(2)便が塊状または硬いことが1/4以上ある.(3)排便が完了しないことが1/4以上ある.(4) (4)排便時に肛門閉塞感があることが1/4以上ある；(5)排便時に手による介助が必要なことが1/4以上ある；(6)排便回数が週3回未満である。 下剤を使用しない軟便はまれである。 過敏性腸症候群（IBS）の診断基準を満たさない。 分類：排便困難と排便障害の発生部位により.慢性機能性便秘症は緩徐伝達型（STC）.排出口閉塞型（OOC）.混合型（MIX）の3つのタイプに分けられる。 1.遅発性便秘：大腸の伝達機能障害を指し.腸の内容物は遅発性伝達によって引き起こされる便秘で.症状は便の数の減少.便の減少または便の消失.硬い便として現れ.通常腹部膨満感を伴い.病気の原因は明らかではなく.頑固な症状で.時間の経過とともに.その症状は徐々に悪化し.患者の一部は最終的に大腸の亜全摘術または部分切除術を実施しなければならない。 臨床研究によると.便秘治療のために刺激性下剤を同時に.特に長期に大量に使用すると.大腸神経叢.間葉系間質細胞.さらには平滑筋の破壊や消失が起こり.最終的に大腸の蠕動運動が著しく弱まったり消失したりして.悪循環に陥ることがわかった。 2.出口閉塞型便秘：（直腸性便秘）とも呼ばれ.組織.臓器の機能的変化により排便出口付近が閉塞し.排便困難や留置便秘を引き起こす症候群を指す。 排便困難.不完全排便感.切迫感.重苦しさ.便の乾燥または非乾燥が便秘の主な徴候である。 一般的な原因としては.直腸の筋力低下（直腸前突.直腸膿瘍.会陰下垂など）.骨盤底筋機能障害（恥骨筋症候群.骨盤底痙攣症候群.内括約筋アカラシアなど）.腸管外閉塞などが挙げられる。 この病気は若い女性に多く.直腸脱便秘も高齢者に多い。 3.混合型：大腸の通過速度が遅く.排出障害が存在することを指し.上記の伝達速度が遅いタイプと出口の閉塞タイプの便秘の特徴があります。