機能性視床下部性無月経の治療は.患者さんに生殖能力の要求があるかどうかで決まります。ホルモン剤の服用により.まず生殖能力の要求がある場合は.正常な月経周期にし.次に排卵促進剤を服用して卵の排出を促します。一般的に使用されるホルモン剤には.プロゲステロン.避妊薬などがあります。一般的に使用される排卵促進剤：クロミフェン.ウロトロピックホルモン.ブロモクリプチンなど。妊娠の必要性がない場合は.ホルモン剤を服用するだけで.正常な月経周期になることが推奨されます。機能性視床下部性無月経の患者さんは.程度の差こそあれ.精神障害を伴うことが多く.重度の精神障害のある方は精神療法の併用が必要です。機能性視床下部性無月経は無月経の中でも重篤な部類に入りますが.医師の指示に従って治療を行えば予後は良好なことが多く.治療後はほとんどの患者さんが無事に妊娠することができます。