ほとんどの下剤には程度の差こそあれ毒性や副作用があり.長期間の使用は次のような結果を招く可能性がある：(1)消化管を刺激し.吐き気.嘔吐.腹痛を引き起こす可能性がある。(2)高張性下剤であるマンニトールのような一部の下剤は.腸壁の組織から大量の水分を引き出し.脱水症状を引き起こす可能性がある。 (3)妊娠中.特に妊娠後期に下剤を乱用すると.流産につながる可能性がある。 (4) 発疹やアレルギー性腸炎などのアレルギー反応を起こす患者が少なからずいる。 (5) また.長期使用により腸壁の神経受容体細胞のストレスが低下し.腸内に十分な便があっても正常な蠕動運動や排便反射が得られなくなり.便秘の治療が困難になることがある。 (6) センナ.ルバーブ.アロエベラなどの刺激性下剤を長期間使用すると.大腸メラノーシスを引き起こす可能性がある。