新生児肺炎はいつまで保育器が必要なのか、一概には言えないが、主に新生児の状態の重症度や病気の回復に左右され、一般的には7日以上生きる必要がある。
新生児は免疫力が比較的低いため、新生児肺炎になりやすく、病状がより深刻な場合、治療のために病院の保育器が必要で、新生児肺炎が比較的軽症の場合、抗感染、ネブライザー治療の後、保育器の中で7～10日ほど生きれば退院できる。
しかし、一部の重症肺炎の新生児、特に未熟児、低体重児、アデノウイルス、呼吸器合胞体ウイルスなどの特殊な病原体による感染症、治療期間中の咳や発熱の再発などでは、治療期間が長くなり、退院までに1ヶ月、あるいはそれ以上の入院が必要になることもあります。 個々の超未熟児では、数ヶ月の入院が必要になることさえあります。
新生児は免疫機能が未熟なため、容態が急変しやすいので、新生児肺炎の場合は、容態を悪化させないよう、積極的に医師と協力して治療を受けることをお勧めします。