1.遺伝的要因
（1）胚／胎児の染色体異常は.胎児流産の最も一般的な原因である。 流産・停止胚の60％以上.特に妊娠嚢の形態が異常な停止・中絶胚の80％以上に様々な種類の染色体異常が検出され.妊娠嚢の形態が正常な中絶・中絶胚でも.約25％に染色体異常が存在することが分かっています。
流産・停留の時期が早いほど.染色体異常の割合が高いことが分かっています。 (2)
夫婦のどちらか（親世代）に染色体転座や逆位があると.胎児の染色体異常が起こり.その結果.発育が停止する。 胎児停止歴のある夫婦には.均衡型染色体転座.ロゼット型転座.逆位が見られます。
両親の染色体転座は.遺伝的に生殖に重大な悪影響を及ぼします。配偶者の一方がバランス型保因者の場合.子孫の染色体が正常である確率は18分の1.バランス型保因者は18分の1.残りの16/18はバランスが悪く異常で.しばしば出生異常や死亡に至ることがあります。 親の染色体ロゼット保因者の遺伝カウンセリング：配偶者の一方が染色体ロゼット保因者の場合.子孫は1/6が正常染色体.1/6が染色体ロゼット保因者.残りの4/6が不均衡な異常となり.発育異常や死亡に至ることがあります。
親の染色体逆位保持者：その子孫は.1/4が正常染色体.1/4が染色体逆位保持者.2/4がアンバランスな異常となります。 (3)
遺伝子変異と胎児流産 遺伝子には.流産時に流産の発生を促進する役割を果たし.流産感受性遺伝子と呼ばれるものと.流産の発生を防ぎ.妊娠を維持する保護的な役割を果たすものがあります。
また.胎児純遺伝子の変異や複合ヘテロ変異は.胎児の発育異常や死亡に至ることもある。 2.母体要因
（1）母体の慢性疾患.生殖器感染症.栄養失調は.流産を引き起こす可能性があります。
特に.TORCH感染.Toxoplasma
gondii感染.風疹ウイルス感染.サイトメガロウイルス感染.単純ヘルペスウイルス感染.マイコプラズマ.クラミジア感染などは垂直感染により胎児の異常な発育を引き起こす可能性がある。 (2)
生殖器の解剖学的異常：子宮奇形.子宮癒着.子宮筋腫.子宮ポリープ.子宮腺筋症.子宮頸管機能不全など。 (3)凝固異常：微小血栓症。 (4)
内分泌因子
黄体機能異常.胎盤機能異常.多嚢胞性卵巣症候群.高プロラクチン血症.甲状腺疾患.糖尿病.など。 (3）父親要因
男性パートナーが慢性的な全身疾患.病原性微生物への感染.精液の異常.悪い生活習慣.職業的要因への暴露.抗精子抗体の産生などを患っている場合。 4.免疫学的要因
胎児流産を引き起こす免疫学的要因には.ABO/RH母子血液型不適合.母体の拒絶反応.阻止抗体の欠如.抗リン脂質抗体症候群.また細胞毒性作用や補体系の活性の増加があります。 妊婦または妊娠可能な年齢の女性は.不安.うつ.自尊心の低下.罪悪感.自閉症.悲観主義.不眠などのネガティブな感情に悩まされ.身体機能が低下し.好ましくは免疫機能障害を引き起こし.最終的には胎児の異常な発育につながる。