小児の扁桃腺肥大は.小児の閉塞性睡眠時無呼吸低換気症候群の主な原因であり.手術が主な治療法ですが.口蓋扁桃を切除すると.子供の免疫機能に影響があるのではないかと心配する親.特に小さい子供（5歳未満）の親が多いようです。
理論的には.口蓋扁桃とアデノイドはリンパ系臓器として咽頭の局所免疫機能に関与し.異物や抗原の体への影響に抵抗しているのである。しかし.咽頭のリンパ組織は内輪と外輪に分かれており.口蓋扁桃やアデノイドは内輪の一部に過ぎないためか.過去100年の口蓋扁桃手術において.免疫不全児の報告は一度もない。
また.親がどうしても免疫機能を心配するならば.手術前と手術後3-6ヶ月に採血して免疫機能をチェックすることができ.通常4-6mlの採血で済み.3-400元で免疫機能の変化を動的に観察することができる。