卵巣機能
排卵障害
卵胞発育異常
排卵障害-ただし.これは子宮内膜症の有無にかかわらず.不妊の原因としてよくあることです。
子宮内膜症の患者さんの中には.卵巣内の卵胞が正常な速度で成長しない方もいらっしゃいます。 正確な原因は不明です。
不育卵胞黄体形成症候群（LUFS)
未破裂卵胞黄体形成症候群の患者さんでは.卵胞は正常に発育しますが.通常腹腔鏡検査や超音波検査で黄体形成ホルモンがピークに達した後.卵がうまく放出されません。
卵子の異常
かつて.子宮内膜症患者では卵子の質が低下していると考えられ.子宮内膜症患者における生殖補助医療（IVF）の成功率の低さを説明することができるとされていました。 しかし.現在の研究では.軽度から中等度の子宮内膜症患者における体外受精の成功率は決して低くないことが分かっています。
精子・卵の輸送
卵管機能異常
子宮内膜組織で作られるプロスタグランジンなど一部の物質は.卵子や受精卵が運ばれないと筋肉の運動機能に影響を与え.不妊の原因になることがあります。
卵管の解剖学的異常
子宮内膜症は骨盤内炎症性疾患を引き起こし.卵管と周囲の骨盤内臓器の癒着.正常な解剖学的構造の変化や卵管内壁への癒着.炎症による卵管壁の線維化などが起こり.卵や受精卵の輸送障害となることがあります。
精子の生存率低下
子宮内膜症による炎症反応は.生殖管内のマクロファージを増加させ.精子細胞を攻撃し.体内での生存率を低下させることがあります。
インプラント
子宮内膜不全
子宮内膜症の患者さんの子宮内膜には.黄体期に受精卵が着床するのに必要な因子が不足していることが多いのだそうです。
免疫因子
腹膜液マクロファージの数および活性の増加
子宮内膜症患者の腹腔液中の様々なサイトカインの数や活性が増加し.精子の生存率.卵の成熟.精子と卵の結合.受精卵の生存率.卵管機能に影響を及ぼすという。
子宮内膜サイトカイン活性の上昇
C3補体.HOXA10.HOXA11.HGFなど.多くの関連因子が受精卵の着床と発育に影響を与える可能性があります。