MRIの検査範囲は広く、神経疾患、甲状腺疾患、肝臓・胆嚢疾患、血管疾患、骨・関節系病変などを調べることができる。 1.神経疾患：神経腫瘍、外傷、先天奇形、出血性・虚血性疾患はMRIで診断できる。 2.甲状腺疾患：甲状腺癌や甲状腺嚢胞などの甲状腺結節やしこりの性質を調べるのに役立つ。 3.肝胆道系疾患：MRIは肝嚢胞、肝壊疽、肝癌、胆石、胆嚢ポリープなどの診断に役立ちます。 4.血管系疾患：MRI血管造影は血管腫や血管狭窄の状態を明らかにすることもできる。 5.骨・関節系病変：MRIは骨感染症、腫瘍、外傷、軟骨、靭帯、半月板、滑膜、滑液包などの関節組織の病変に対して高い診断価値を持つ。 MRIは脳や脊髄の疾患も検出することができ、脳幹、小脳、その他の後頭蓋窩の病変、脊髄、椎間板、その他の軟部組織の疾患において、CTよりも大きな利点がある。