毒性赤痢の治療は.対症療法と原因療法に分けられ.対症療法には冷却.通常は物理的.必要なら薬物的な治療も含まれる。アロパシー治療では.抗生物質を適切に使用する。
ショック患者に対しては.ブドウ糖生理食塩水による血液量の拡大とアシドーシスの是正.血管作動薬による微小循環障害の改善と重要臓器の保護.ヘパリンなどによる抗凝固が主な治療となる。脳症患者に対しては.マンニトールで脳浮腫の軽減.血管作動薬で脳微小循環の改善.呼吸刺激薬や人工呼吸で呼吸不全の予防を行う。
原因療法としては.第三世代セファロスポリン系やキノロン系を中心とした抗菌薬療法が主体である。