肝腫瘍には良性肝腫瘍と悪性肝腫瘍があり、腫瘍の性質や病期、治療法の選択、術後のケア、体質などが異なるため、肝腫瘍患者の予後は一概に言えない。
一般的な良性肝腫瘍には、肝腺腫、血管腫、悪性腫瘍などがある。小さな腫瘍は通常、臨床症状を示さないが、肥大後に隣接臓器を圧迫するため、心窩部不快感、腹痛、腹部膨満感、腹鳴などの症状を引き起こすことがある。 そのほとんどは超音波検査などで発見でき、根治手術後の生存期間に明らかな影響はない。
肝悪性腫瘍（＝肝細胞がん）には、原発性肝細胞がんと転移性肝細胞がん（胃がん、転移性大腸がんなど）があり、肝悪性腫瘍は血液供給が豊富で、陰湿かつ急速に増殖するため、全体的な予後は楽観できない。
結論として、肝腫瘍患者の予後は一概には言えないが、腫瘍の良性・悪性の種類（悪性腫瘍の場合は病期分類も合わせて）、患者の全身状態、治療法の選択などと合わせて分析する必要がある。