臨床では、磁気共鳴は腫瘍を検査する重要な方法の一つであるが、すべての腫瘍を磁気共鳴で診断できるわけではない。 腸腫瘍、呼吸器腫瘍などでは、磁気共鳴の診断効果は比較的低く、神経腫瘍、一部の固形腫瘍などでは、磁気共鳴の診断効果は高い。 磁気共鳴は実質臓器の神経、血管、繊維組織などの構造関係をより詳細に識別できるが、肺、胃、腸などの空洞臓器の分解能は比較的低い。 臨床では、MRIは主に実質臓器の腫瘍検査に応用されている。 磁気共鳴は腫瘍検査に用いられるだけでなく、腫瘍の良性・悪性の判定にも一定の意義がある。 磁気共鳴は骨転移、脳転移、リンパ節転移などを有する腫瘍の判定に一定の役割を果たす。 磁気共鳴は腫瘍の良性・悪性の判別に一定の識別力を持つが、腫瘍の性質を明らかにするためには、やはり専門的な病理検査が必要である。