手術は被膜の根絶のために望ましい方法であり.圧迫症状や合併症が生じる前に行う必要があります。手術には大きく分けて.内果皮切除術と外果皮切除術の2種類があります。 内嚢切除術では.まず細い針で体液を除去し（体液がこぼれないように）.その後.内嚢を切除します。内果は外果に軽く付着しているだけなので.はがしやすく.完全に取り除けることが多いです。また.肺.脳.骨などの包嚢を除去する必要があります。外科的に内嚢を除去する前に.高張食塩水を内嚢に注入して原虫を死滅させる。 病変の位置や大きさによっては.外被切除術を適宜行うこともある。 ベンゾイミダゾール系は.近年.国内外で研究され.動物実験に基づいて臨床使用され.一定の効果を上げている抗蠕虫薬である。WHOの見解では，アルベンダゾールとメベンダゾールの両剤が抗蠕虫薬の第一選択薬として挙げられている。 その適応症は以下のように考える著者もいる。一次性肝・肺嚢胞性条虫症の破裂後.あるいは条虫手術時の保護不良.診断用穿刺の誤用により条虫液が溢出し.二次的に着床が広がり.腹腔内あるいは胸腔内に病変を生じ.外科的な駆除が困難な二次性腹腔内あるいは胸腔内条虫症 多発性あるいは多臓器にわたる嚢胞性円皮症.あるいは再発性円皮症で.患者が再（多）手術に応じない.あるいは応じにくい場合。 高齢で虚弱な患者.または重要臓器の器質的疾患が併存し.手術耐容能が不良な患者。 進行した肝小胞性コクシジオイデス症で外科的治療が困難な場合.肺転移や脳転移がある場合は.薬物療法により症状の緩和や生存期間の延長が可能である。 嚢胞性.小胞性コクシジオイデス症にかかわらず.術前.術後の補助療法として化学療法を行うことで再発率を下げ.効果を高めることができる。 コベンダゾールの導入後，封入虫症の治療にはメベンダゾールに代わる傾向がある。アルベンダゾールは吸収がよく.血清中濃度はメベンダゾールの100倍である。また.嚢胞液中の濃度はメベンダゾールの60倍である。 嚢胞性Encystercosisの治療では.用量は1日10〜40mg/kg.2回に分けて.30日を治療コースとして.いくつかの連続したコースの状態に応じて.治療のコースは.特に肺嚢胞性疾患に対して.メベンダゾールより優れています。小水疱性嚢胞症の場合，中国ではアルベンダゾールの高用量による長期治療を提案する人もおり，1日量は20mg/kg，治療期間は17ヶ月から66ヶ月（平均36ヶ月），長期経過観察の結果，CTスキャンで明らかな経過が見られ，ほとんどの症例が元の病変部の石灰化により治癒し，効率は91.7％であった。 患者は長期治療に概ね耐えられ.重篤な毒性副作用は認められなかったが.治療中は肝機能.腎機能.骨髄のフォローアップを行うことが推奨される。妊婦には禁忌である。 メベンダゾールは.海外では投与量や治療コースを変えて使用されています。投与量は1日20～200mg/kg.通常は1日40～50mg/kgを3回に分けて1ヶ月間経口投与し.その後半月休薬して再度3ヶ月間の治療コースが一般的です。また.嚢胞性嚢胞虫症の治療には1～6ヶ月の投薬が必要ですが.小胞性嚢胞虫症の治療には3～5年までの長期間の治療が必要であるとされています。 嚢虫症の中には完治が期待できるものもあり.肺嚢虫症は肝嚢虫症よりも有効である。メベンダゾールは吸収が悪く.空腹時には一般に1％しか吸収されない。効果を高めるためには.脂肪分の多い食事と一緒に服用すると.薬剤は脂肪で吸収されやすくなる。