腸内フローラを整える薬としては、乳酸菌錠、バチルス・リケニフォルミス生菌カプセル、ビフィズス菌3倍生菌カプセル、ビフィズス菌4倍生菌錠、サッカロミセス・ブーラルディ粉末、バチルス・コアギュランス生菌錠などがある。 1.ラクトバチリン錠剤：ラクトバチリン錠剤は腸内細菌叢を調整し、胃分泌を促進し、消化不良や腸炎を適応症とする。 副反応は明確ではないが、ラクトバチリン、乳糖、ガラクトース、乳製品アレルギーは禁止されていることに注意すべきである。 2.バチルス・リケニフォルミス生菌カプセル：バチルス菌、ビフィズス菌などの細菌に対する促進作用と、いくつかの病原性微生物に対する拮抗作用があり、腸内細菌叢を整えることができ、慢性腸炎、細菌性下痢などの適応がある。 なお、過剰摂取で便秘になることがあり、アレルギーのある人は摂取を禁じられている。 3.ビフィズス菌トリプル生菌カプセル：ビフィズス菌（Bifidobacterium longum）、乳酸菌（Lactobacillus acidophilus）、腸球菌（Enterococcus faecalis）を主成分とする複合製剤で、人体の正常な生理細菌を直接補充し、腸内細菌叢のバランスを調整することができる。 アレルギーをお持ちの方は摂取をお控えください。 4.バチルス・コアギュランス（Bacillus coagulans）生菌錠剤：腸内フローラのアンバランスが原因で起こる下痢やその他の疾患の治療。 微生物製剤にアレルギーのある人は使用できない。 患者は医師の指導の下で薬を使用する必要があり、投与量は医師の指示に従うべきであり、重大な結果の出現を避けるために、タイムリーに医師と通信するために副作用の出現。