浸潤性胸腺腫の正確な生存期間は不明であり、一般に患者の臨床病期と強く相関している。
早期患者は一般に生存期間が長く、5年生存率は約80％に達しうるが、後期患者は生存期間が短く、場合によっては数ヵ月しか生存しないこともある。
胸腺腫は一般的な縦隔腫瘍病変であり、臨床的に浸潤性胸腺腫患者の生存期間は一般的に患者の病期と密接に関連しており、一般的に病期が早ければ早いほど患者の生存期間は長くなる。
根治手術が可能な早期の浸潤性胸腺腫患者の5年生存率は約80％に達し、治癒した患者はより長期間生存できることが研究で確認されている。 一方、根治手術が受けられない後期患者は、生存期間が数カ月と著しく短くなる。