心肥大を起こす高血圧をコントロールする薬を、大きな違和感なく服用する必要があるのでしょうか?

必要です。
高血圧が心肥大を起こすということは.心臓の構造変化を起こしているということであり.心筋リモデリングを改善するために.ACEI様薬と他の降圧剤を併用した治療が可能である。