植物神経障害の治療には、一般治療、薬物療法、手術がある。 植物神経障害が治るかどうかは、患者の症状の程度に関係する。 1.一般治療：軽度の植物神経障害であれば、運動、足浴、規則正しい食生活、気分の詰まりをなくすことなどで治療でき、一部の患者の症状は改善される。 2.薬物治療：植物神経障害患者の半数以上は心理社会的障害や家族機能不全があり、不安や抑うつなどの明らかな陰性感情があるため、セルトラリンやシタロプラムなどの抗うつ薬や抗不安薬を精神療法と併用する。 3.外科的治療：上記の方法で効果がない場合は、外科的治療が考慮される。 植物神経系は内臓痛や多系統の機能調節に広く関与しており、植物神経の化学的遮断や高周波変調は植物神経機能障害に関連するさまざまな症状の治療に用いることができる。 植物神経障害は予防や治療が可能であり、医療専門家の指導のもとで可能な限り積極的に治療すべきである。 薬物療法は、医師の監督下で使用すべきである。