国内外に多くの手術法がありますが.家庭の事情（経済的余裕や伝統的な考え方など）を考慮して.会陰肛門の変形を修正しながら肛門を再建し.腸の開存性を回復することが最終目的です。 1.ディスポーザブル後肛門形成術：低位肛門閉鎖症が明確に診断された小児（特に男性）に対して.神経筋刺激装置を用いて外肛門拡張器の位置を決定し.後肛門形成術を簡便な方法で.短い手術時間.早い回復で行うことが可能です。 2.第一期人工肛門：中等度から高度の肛門閉鎖症と診断された男児.特に直腸瘻やその他の異常に複雑な瘻孔が明確に診断された場合は.段階的に手術を行い.第一期下行結腸瘻の位置を慎重に選択しなければならない。
瘻孔の修復と肛門形成術を同時に行う必要がある。 pena法の主な要素は.直腸瘻の修復.盲腸の変位.直腸背部の狭窄.骨盤底筋群の再建である。
直腸瘻は女性の乳児にはまれであるため.pena法とは特に男性の肛門と尿道との関係を再構築することを指す。 この手術は複雑で技術的に難しく.その技術的詳細は術後の肛門の外観と排便機能に直接関係します。 4.後方矢状面形成術（尾部形成術）：通常.高い盲端と複雑な瘻孔を持つ乳児.特に直腸陥没をもたらす手術の失敗歴を持つ乳児に用いられ.女性の乳児に多く.瘻孔が尿道と関連していないので尾部形成はペナと比べて比較的単純である。 5.会陰部形成術：低位無症状の多くは異所性排便を呈する異常瘻孔や瘻孔路を伴っており.このような患者や肛門前方変位を伴う患者には会陰部形成術が適応となる。 6.複合腹膜肛門形成術：直腸の盲端が腹膜の後屈より上にある特殊な患者は.会陰を介した直腸の下方移動が完了できず.必要に応じて開腹手術で補助具を緩める必要があり.複雑で時間がかかり.手術の大きな痛手となる。 7.腹部-仙骨複合形成術：必要に応じて仙骨を介して手術を完了することはできません.開腹手術は.操作を支援するために必要であることは困難である。