小児の扁平疣贅の主な原因は感染と体の免疫機能の低下である。
1.感染：扁平疣贅はヒトパピローマウイルスの感染によって引き起こされ、ウイルスは直接または間接的な接触感染によってヒトの皮膚に到達し、あるいは微小な小胞の接触によって細胞内に侵入する。 主な感染経路は、直接接触感染、針、ブラシ、タオルなどの汚染物を介した間接感染である。
2.体の免疫機能が低下している：体の免疫機能が低下しているか、外傷がある場合、ウイルスに感染しやすい。hiv感染、腎臓移植、悪性リンパ腫、慢性リンパ性白血病、大量のグルココルチコイドの長期投与などは、体の免疫機能が低下していることが原因である可能性がある。
扁平疣贅に罹患している子供たちは、適時に病院で治療を受けることをお勧めします。