プロバイオティクスの摂取は朝でも夜でも効果に大きな影響はないため、2つの時間帯を比較することはできない。
現在、臨床で一般的に使用されているプロバイオティクス製剤（ビフィドバクテリウム・ビフィダム4倍生菌錠、乳酸菌錠、バチルス・リケニフォルミス生菌カプセルなど）の多くは1日2～3回投与であるため、朝服用しようが夜服用しようが効果に大きな支障はない。 したがって、2つの時間帯に使用した場合の効果の比較値はない。
また、プロバイオティクスの禁忌と副作用に注意する必要があり、もし患者にそのような薬剤を使用する必要がある場合は、医師の指導のもとで薬剤を使用する必要があります。