1985年Barkerらによる中枢神経系への磁気刺激の導入は.運動誘発電位を耐え難い経頭蓋電気刺激の時代から無痛で非侵襲的な経頭蓋磁気刺激の時代へと導き.今では臨床で日常的に用いられ.多くの神経疾患の診断と予後評価に欠かせない神経生理学的手法となった。 経頭蓋磁気刺激による運動誘発電位は.現在.中枢運動神経系を評価するための唯一の有効な神経生理学的手段である。 主に運動機能を伴う神経疾患（運動ニューロン疾患.多発性硬化症など）の診断や予後予測（虚血性脳血管障害など）の補助として使用されています。 うつ病に対する反復経頭蓋磁気刺激（rTMS）の最初の症例報告は1993年に.パーキンソン病に対するrTMSの最初の論文は1994年に発表されました。 1994年にパーキンソン病の論文が発表されて以来.虚血性脳血管障害.認知機能障害（認知症）.不安神経症.強迫性障害.片頭痛.さらには難治性てんかん.さらには失語症.嚥下障害.耳鳴りなどに関する研究が盛んに行われるようになりました。