先天性心疾患には多くの種類があり.いずれも心機能や肺機能にさまざまな影響を与え.重症化すると生命を脅かすこともあります。 緊急治療を必要とする主な疾患は以下の通りである：（1）特定の複雑な先天性心疾患の一部は.出生後に発見され診断されるとすぐに手術する必要があり.さもなければ根治手術の最善の機会が失われる.例えば：心室中隔がそのままの大動脈転位.大動脈弓離開.低形成左心症候群など。 (2) 先天性心疾患の中には.心不全や重症肺高血圧症を急速に進行させ.早期の外科的介入を必要とするものがある。例えば.完全肺静脈異所性排水.心室中隔欠損を伴う大動脈狭窄.永久動脈幹.制限されていない大きな心室中隔欠損などである。 (3）チアノーゼを伴う先天性心疾患では.低酸素症を頻発したり.チアノーゼや低酸素症の悪化が持続する場合があり.生命に危険を及ぼすため.緊急の治療が必要な症例がある：重症ファロー四徴症.肺閉鎖症（無傷心室中隔）.三尖弁閉鎖症など。