汎血球減少症は、その原因に応じて治療が必要である。 一般的な原因としては、再生不良性貧血、巨赤芽球性貧血、白血病、骨髄異形成症候群などがある：
1.再生不良性貧血（再悪性度貧血と呼ばれる）：主な治療法としては、支持療法、造血幹細胞移植、免疫抑制療法などがある。 非重症のレトロウィルスは、アンドロゲンやシクロスポリンで治療することができます。 重度の再閉塞：年齢が40歳未満の場合は、できるだけ早期に造血幹細胞移植を行うことが望ましい。年齢が40歳以上の場合は、できるだけ早期に集中的な免疫抑制療法（抗胸腺細胞グロブリン療法または抗リンパ球グロブリン療法とシクロスポリン療法の併用）を行うことが望ましい。
2.巨赤芽球性貧血：通常、葉酸またはビタミンB12の補充が治療法として選択される。
3.白血病：特定の白血病では末梢血中の3系統が減少することがあり、状態に応じて化学療法、造血幹細胞移植などの治療法が選択される。
4.骨髄異形成症候群：支持療法、造血因子療法、化学療法併用、造血幹細胞移植などが病態に応じて選択される。
汎血球減少症は他の原因で起こることもあるので、発症したらすぐに病院の血液内科を受診し、原因を突き止め、的確な治療を行う必要があります。 やみくもな自己治療は避けるべきである。