1.肝細胞核に頑固に存在するCCCDNA：肝細胞膜に吸着したB型肝炎ウイルス.肝細胞血漿中にHBV DNAを脱嚢した後.さらに肝細胞核に入り.ポリメラーゼが陽性DNAの割れ目部分を修復して.B型肝炎ウイルスの初期CCCDNA（共有結合性の閉ループDNA）.CCCDNA構造変化と核タンパク質結合を形成し.HBV複製の長期テンプレートとなる。 CCCDNAは半減期が長く.肝細胞の分裂に伴って新しい肝細胞に入ることができ.HBVは肝細胞に侵入し続け.新しい核内CCCDNAを形成してCCCDNAプールを増加させていくのである。現在までのところ.直接的な抗CCCDNA薬はありません。既存の抗ウイルス剤は.主にCCCDNA以下の複製期に作用する。 一部の薬剤がCCCDNAを減少させることが報告されているが.その効果は間接的なものがほとんどである。 そのため.複製の鋳型が取り除かれないうちは.B型慢性肝炎を根絶することは困難です。 近年.少数派のB型慢性肝炎患者においてHBsAgが消失すると.血清中のHBV DNAは検出されず.肝組織の炎症も消失するが.回復したB型肝炎患者の37％では依然として肝組織にCCCDNAが低レベルで発現し.CCCDNAが残存していることが報告されています。 現在の治療では.ウイルスの複製を阻害し.肝障害を軽減し.修復を促進し.肝機能を改善することしかできません。 2.HBVの遺伝子型：HBV全体の遺伝子の塩基配列のヘテロ接合率≥8％.またはS遺伝子領域の塩基配列のヘテロ接合率≥4％を標準として.HBVは8遺伝子型に分けることができます：すなわちA.B.C.D.E.F.G.H。中国は主にBとC型.BよりもC.他のタイプ.C型とB型よりも悪いより現在の抵抗B肝炎ウイルスにこれら2種類.統計的には.C型より。 統計的には.C型はB型に比べて肝組織の損傷が大きく.プレCおよびCプロモーターの変異が多く.抗ウイルス剤への反応性が悪く.予後不良である。 そのため.中国やアジアのB型肝炎は.他の地域よりも治療が難しいと言われています。 3.年々増加するHBe抗原陰性B型慢性肝炎：現在.B型慢性肝炎は.HBe抗原陽性B型慢性肝炎とHBe抗原陰性B型慢性肝炎に分けられますが.HBe抗原陰性B型慢性肝炎は.HBeAg陽性B型慢性肝炎とHBeAg陰性B型慢性肝炎に分けられます。 中国大陸では.HBeAg陰性慢性B型肝炎が緩慢なB型肝炎の約21％を占めていると報告されています。これは.主にHBVが自身の逆転写酵素とポリメラーゼを用いて複製されますが.この酵素には自己修復作用がなく.複製過程でのヌクレオチド置換率が年間2.1×10-4/ntと高く.患者の体内で支配ウイルス株以外に多くの準種が存在し.体の免疫系が感染すると 体の免疫システムがHBVの野生株（自然株）に対して強い特異的な免疫反応を起こすと.野生株は抑制されるが.変異株は確立した抗ウイルス免疫から逃れ.劣勢な株から徐々に優勢な株になっていくことができるのだ。 自然条件下では.プレC遺伝子とCプロモーターの変異が多く.HBeAgは複製できないが.C抗原は複製できるのでHBeAg陰性となるが.HBV DNAはまだ著しく複製されているので.B型慢性肝炎ではHBeAg陰性となる。 HBV DNA遺伝子B型とC型には.プレC遺伝子とCプロモーター変異が起こりやすく.C型の方がB型より起こりやすいためである。 したがって.中国の慢性B型肝炎のうち.HBeAg陰性でも抗HBe陽性であれば.HBV DNAはまだ明らかに1/5程度複製されており.このタイプの肝炎は経過が長く.重症肝炎や肝硬変になる率が高く.臨床治療が困難であることがわかります。 4.HBV感染に対する免疫寛容：HBVの母子感染や幼児期の感染により.ヒトの免疫系にHBVに対する免疫寛容や部分寛容が生じ.HBVに対する体の特異的な免疫を活性化してウイルスを排除することが困難になることが多くあります。 現存するHBV感染者の約40％がこのタイプで.成人してから徐々に免疫クリアランス期に入ると推定されています。 5.隠れB型肝炎：隠れB型肝炎は主にS遺伝子の変異によるもので.一般的にはS遺伝子のコドン145のアラニンがグリシンに置換されることにより.HBsAgはまだ複製されているが.変異により現在の酵素結合免疫測定抗HBsと結合できず陰性化する。 主な違いは.HBV DNAの複製レベルがまだ高く.ALT/ASTが上昇していることです。 HBsAg陰性のHBV変異体の人口における有病率は.1.9％から3.4％の範囲である。 そのため.診断が難しく.合理的な治療が遅れており.非B型および非C型慢性肝炎の半数以上を占めると推定されています。