1.身体検査：腹圧.腹部緊張の有無.腸音亢進の有無などを判断する。2.検査：（1）検便：便の外観.顕微鏡検査.培養を含む。便のルーチン検査（赤血球.白血球.原虫.卵.脂肪滴）.潜血検査.便培養.便脂肪定性検査（スーダンIII染色）.便電解質.pH検査などが病因の判断に有用である。(2) 血液生化学検査：血液.電解質.血清総蛋白.CRP.赤血球沈降速度など.患者の病原性細菌への感染.貧血などの症状を把握することができる。3. 画像検査：(1) X線バリウム食またはバリウム注腸：全消化管の機能状態を観察し.器質的病変の有無を初期判定する。(2) 大腸内視鏡検査：回腸末端までアクセスし.大腸粘膜を直接観察し.必要に応じて組織生検が可能である。(3) 小腸顕微鏡検査：小腸病変が疑われる場合.あるいは除外する必要がある場合に選択することができる。(4) カプセル内視鏡：非侵襲的な消化管検査法ですが.繰り返し観察ができず.観察の焦点も定まりません。