中咽頭癌のリンパ節転移では、各患者の生存期間を正確に述べることは不可能であり、臨床的な推定には一般に5年生存率が用いられ、その幅は19％から60％である。 しかし、ルーチンの病理学的結果が優先されるべきである。
中咽頭癌のリンパ節転移は進行期であることを意味するが、放射線治療に対する感受性は高い。 系統的治療後の生存期間は、扁桃癌、舌根部癌、軟口蓋癌、咽頭壁癌に分類される中咽頭癌によって異なる。 患者の生存期間を決定するには、一般に5年生存率（5年以上生存する患者の割合）を用いて推定される。
扁桃癌の転移後の5年生存率は20～40％である。 舌根部がんの放射線治療後の5年生存率は30％から60％で、軟口蓋がんも同様で、咽頭壁のがんは比較的予後が悪く、5年生存率は約19％から20％である。 一方、放射線治療や放射線療法、化学療法、補助療法を併用する必要がある。
中咽頭癌と診断されたら、予後に影響を与えないように、遅滞なく治療を受ける必要がある。