私たちの腸内には巨大な生物集団が増殖しており.それらは私たちの生活に密接に関係している腸内細菌です。
腸内細菌には.よく腸内フローラと呼ばれるもののほか.ウイルスや真核生物も含まれています。腸内フローラは現在.ファーミキューテス.バクテロイデテス.アクチノバクテリア.プロテオバクテリアを中心に.2000種以上.数は人体の細胞数より多い1014種と考えられています。ヒトマイクロバイオームプロジェクトにより.腸内フローラは個々人で異なり.指紋のような特異性を持つこと.双子のマイクロバイオータは50％近く類似していることが明らかになっており.腸内フローラの構成には宿主の遺伝子型が大きく関与していること.ヒトフローラは一度成立すると比較的安定しており.食事と薬剤がその構成を変える主要因であることが示されています。ヒトの腸内フローラは一度確立されると比較的安定しているが.その組成を変化させる主な要因は食事と薬物である。高脂肪.高糖分.高タンパクの食事を1日続けると.腸内細菌叢が大きく変化することが研究で明らかにされています。高脂肪食の人はBacteroides intestinalisが優勢であり.高炭水化物食の人はS. intestinalisが優勢であることが分かっている。抗生物質が腸内フローラに与える影響は極めて重要であり.中には壊滅的なダメージを与えるものさえある。抗生物質投与後.数ヶ月間回復が困難なコロニーもあり.特定の種が減少したり.長期間消滅することもある。
では.ヒトの腸内フローラはどのようにして成立するのだろうか。以前は.胎児は無菌状態であると考えられていましたが.現在では少量の細菌が胎児に存在することが分かっています。出産は体が初めて細菌に触れる機会であり.自然分娩の赤ちゃんの細菌叢はお母さんの膣内細菌叢と似ていますが.帝王切開で出産した赤ちゃんの細菌叢は主に皮膚細菌叢であるStaphylococcus spp. 幼児期の腸内フローラは好気性菌が主体で.補食や固形食の追加とともに徐々に嫌気性菌に置き換わっていく。
腸内フローラが人体に与える影響とは？腸内細菌は.数百万年前から哺乳類とともに進化してきた。哺乳類の免疫系の発達・成熟には腸内細菌が必要であり.無菌状態の動物では.sIgAの減少.消化管関連リンパ組織.パイエル小胞.腸間膜リンパ節の欠損が見られるとされています。腸内フローラは.ビタミンB群（ビタミンB1.B2.B6.B12）.ビタミンK.ナイアシン.パントテン酸など.さまざまなビタミンを合成している。また.タンパク質残基を利用して.アスパラギン酸.アラニン.バリン.スレオニンなどの非必須アミノ酸を合成し.糖やタンパク質の代謝に関与するほか.鉄.マグネシウム.亜鉛などのミネラルの吸収促進や.腸内食物繊維の分解 産生された短鎖脂肪酸は大腸細胞の必須エネルギー源となる。
エンテロウイルス数はおよそ108で.95%のウイルス集団は生涯を通じてほとんど変動がない。
アレルギー性疾患.自己免疫疾患.肥満.糖尿病.クローン病など.多くの疾患が腸内フローラの変化と関連していることが分かっている。クローン病は.環境要因に応じた腸内細菌に対する体内の免疫組織の不適切な反応によって引き起こされる慢性的かつ持続的な炎症反応である。クローン病の発症には腸内細菌が重要な役割を担っており.無菌状態の動物では腸の炎症は起こりません。クローン病患者の腸内フローラは正常者と異なり.感受性遺伝子だけでなく.食事や薬理学的な要因も関与していることが研究で明らかにされており.正常な親族の糞便から作ったカプセルを胃管から服用したり飲み込むことで.クローン病患者の治療ができることが示されている。
結論として.腸内細菌は私たちの健康や病気と密接に関係しており.腸内細菌と病気の関係については.現在ようやく解明されたばかりで.もっともっと深い探究が必要であると言えます。