単一の抗生物質が幽門に影響を及ぼすことがあるが、これは主にピロリ菌感染に関連している。 ヘリコバクター・ピロリは人体の幽門に寄生することが多い細菌の一種で、胃びらん、胃潰瘍、十二指腸潰瘍、胃がんなど多くの消化器疾患の原因菌である。 抗生物質の単独服用は、初期にはピロリ菌を殺菌・抑制することができるが、一般的にピロリ菌の感染を完全に根絶することは困難であり、時間の経過とともに耐性菌が徐々に増加し、その結果、抗生物質の単独服用は効果が減少し、ピロリ菌の治療に寄与しない。 非アレルギー性で健康な幽門に抗生物質を単独で使用すること自体に害はないが、抗生物質の長期使用は健康によくないので、抗生物質は盲目的に自己投薬するのではなく、医師の指導の下で使用すべきである。