牡蠣には不眠症、突発性発汗（日中に不随意に発汗し、発汗のわずかな動作で悪化する）などに効果があり、関連疾患に罹患している人は医師の処方に従って薬を服用して治療できるが、長期間の服用は勧められず、具体的な治療経過は医師の指示に厳密に従う必要がある。
牡蠣は精神を安定させ（鉱石などを用いて精神を安定させる）、陽を沈め陰を補い、節を軟らかくして散らす（硬いしこりを軟らかくして散らす）作用があり、塩辛い風味で少し冷たい性質があり、肝・胆・腎の経絡に帰する。 動悸や不眠、めまいや耳鳴り、瘰癧（主に首のリンパ節の結核を指す）、痰核（皮下にできた核のような腫れたしこり）などの治療に用いられる。
牡蠣の焼成は、収斂（収れん）、制酸、鎮痛（胃酸を抑制し、痛みを抑える）作用がある。 自然発汗や寝汗（入眠後に異常に発汗し、起床後に発汗が止まる）、精子無力症、月経困難症（月経量が過多または数滴以上）、胃痛、呑酸（胃から口やのどに上がってくる酸を飲み込む）などに用いられます。
牡蠣は長期間服用すると便秘や消化不良を起こしやすい。