脳幹出血は、理想的には後遺症のない状態、すなわち正常な状態にまで回復させることができるが、より重篤な状態の患者は、機能障害が残ったり、短期間で死亡したり、植物状態に陥ったりすることもある。
脳幹出血の量が少なければ、積極的な治療によって正常な状態、すなわち脳幹出血前の状態に回復することができる。
出血量が多かったり、治療が適時に行われなかったりすると、予後は通常不良で、中には植物状態に陥ったり、短期間で死亡したりすることもあり、たとえ覚醒して危険な時期を乗り越えられたとしても、さまざまな程度の機能障害が残ることになる。
まとめると、脳幹出血の回復の程度は、出血の量と、総合的な状況を見極めて適時治療を行うかどうかで決まるので、出血後の定期的な治療を受けるためには、時間内に医師に相談することが必要である。